Частица で указывает, что предшествующее существительное обозначает инструмент или средство, при помощи которого выполняется действие N. В данном примере это средство передвижения. Глагольная форма あるいて «пешком» – так называемая て-форма – будет введена в уроке 10.
うちから えきまで バスで いきます。
Я добираюсь от дома до станции на автобусе.
えきから がっこうまで あるいて いきます。
От станции до школы я хожу пешком.